中医一直是很多疑难杂症患者常用的治疗方法。对这些疾病西医一直没有很好的治疗方法，甚至不能让症状产生改善，所以不少患者选择中医继续治疗。这些患者对中医的看法大多为：治疗时间长，疗效有限，很难坚持，但总比西医一直治疗没有改善要好些。
孔令新推出ISA 疗法后，数以万计的前列腺疾病患者在积善堂康复，这些康复患者都是按医嘱进行认真治疗的患者。治疗的时候认真对待医嘱，他们的康复效果也就很理想。但也有不秒患者不按医嘱进行治疗，导致各种各样的问题开始出现。
前列腺疾病的治疗是非常细致的过程。在治疗之前，积善堂就会告诫患者：在治疗当中不要服用别的中药，最好不要服用药品。如果有需要服用别的药品，请先向积善堂说明。这个说明很多患者都知晓，积善堂做这个说明是因为：中药讲究君臣辅佐，药性调和。在治疗当中服用别的药物有可能会影响患者治疗。几乎所有的患者都表示：明白。但是结束却不一而同。
有的患者在服用别的药品时会向积善堂提前说明，积善堂会认真询问患者服药的原因，所服药品的名称。如果与积善堂的治疗不冲突，积善堂会让告诉患者：“没有关系，可以服用。”如果患者服的是中药汤剂或者中成药，积善堂会建议患者：“请先暂停治疗，等你的中药服完后，再进行治疗。”很多患者都发现如果是服用西药，积善堂一般不会建议患者停止ISA疗法，但如果是服用中药，积善堂就会建议患者治疗。
孔令新说：“这是因为西药常常是提纯或者合成的，一般一种西药就解决患者的一个问题。西药里的成份都会标注得很明白。因为西医是批量生产，药剂的含量，及服用后在人体内达到多少药物浓度，什么时候能完全排出人体外都是有据可查的。只要知道了患者服用哪一种西药，我们就知道跟我们的治疗有没有冲突。只要是没有冲突就可以服用。但是中药不同。中药乃至中成药都是复合处方，多种药材相辅相成，彼此克制毒性的同时，还要把药材最好的药性激发出来。每一剂处方是针对一位患者进行的，但是这剂处方并不止解决患者的一个问题，而是解决这个患者的大部分问题，这就决定了中药的药性远比西药复杂，常常会跟ISA疗法形成药力冲突，导致治疗效果变差。所以我们在这个时候是要建议患者先停止ISA疗法， 先进行别的治疗，等别的疾病改善之后，再继续ISA疗法。这不仅是让患者对于突发疾病有一个良好的治疗，同时也保障了两套治疗互相之间没有冲突。”
还有一部分患者一直有着服食补肾壮阳保健品的习惯，在积善堂治疗后，还在偷偷服食。因为这类患者觉得这些保健品对自己的性功能有着显著的提高，停止服食后性功能会下降。为了保障自己的性功能不下降，他们就在治疗的同时服用这些补肾壮阳保健品。还有一位患者说过：“买这些挺贵的，不吃完觉得太浪费了，所以我想一边治疗一边服用，反正服用完了就不再买了。而且我也在治疗，应该没什么问题。”
这正是孔令新最担忧的一个情况。前列腺疾病一定会影响患者的性功能，有的患者很快就出现性功能下降的问题，还有患者性功能下降比较缓慢所以显现得症状较为轻微。但是几年下来，性功能也受损厉害。前列腺疾病的治疗又是见效非常缓慢的，性功能的康复更慢，这就让不少急于康复性功能的患者在治疗的同时也服用补肾壮阳保健品。
孔令新说：“补肾壮阳是一个被过度解读的中医名词。其实真正的补肾是指通过是指通过饮食、药补、健身运动、气功、针灸、按摩等手段达到改变肾阴虚、阳虚的状态；而壮阳则是指通过气功、饮食、药物、针灸、按摩、运动等手段提高男子阳性气息，达到提高肾阳、强阳健体、提升性能力的目的。食补和药补在其中只占很小的一个部分，更重要的是运动和保健。对于自己的问题没有清楚的认识，就道听途说，按个人的错误理解来改善自己的问题，不但不能让患者的病情减轻，反而还会让患者的问题越来越严重。”
孔令新还说：“补肾壮阳真不是吃个保健品那么简单，不知道自己的问题，补反而会补出问题来。很多壮阳的保健品都标示着：全天然。可是真的是全天然吗？很多珍贵的成份都要经过提纯，提纯工艺各不相同，往往一大堆药材只能提出极少量的有效成份，甚至不够装满两个胶囊。那么一瓶保健品里到底装的是什么可想而知了。很多东西服下去容易，但要取出来就难了。就像那位认为自己买的保健品比较贵，治疗后还在服用的患者，最终就是他的病情一直严重。至少在服用保健品的那段时间，他的病情没有丝毫改善，还时不时出现症状加重。为了真正知道他的症状加重的原因，我们认真跟他进行了沟通，才知道他病情加重的原因是他在治疗的同时偷偷服用壮阳保健品。结果就是他的疗程加长，因为服用了保健品他的症状加剧，病灶受到刺激，病情加重。”
为了更进一步的了解患者的身体状况，积善堂的医护人员都要认真询问过患者之前的治疗经历，并且认真记录。这不止是对患者的过往治疗进行记录，还可以看到患者的腺体接受过哪些治疗，对腺体的刺激到了哪一步，这都是积善堂治疗时参考的重要资料。曾经有患者说过：“我来治，你们给我治就行了，问那么多干嘛？我之前治的不好，也记不得了。”
对此，孔令新回答：“了解患者的治疗历史，有助于我们对患者的治疗有一个深入的了解，对腺体受到的刺激有清楚的认知。这些资料在治疗时会成为参考。因为治疗都会对腺体形成一定的刺激，哪怕是ISA疗法，对患者的腺体也是有一定刺激。不刺激也不能激活腺体的神经和血管。那么，知道患者进行过哪些治疗有助于我们清楚地判断患者的治疗会是什么情况，同时还能让我们清楚的预后，让患者知道自己的治疗大约需要多长时间。”
不少患者都在康复的时候说：“孔院长，你的治疗真的是奇迹，我本来已经去过多家医院进行治疗，已经觉得失去希望了，最终是在你这里康复的。真的太意外太神奇了。”
这样的感谢孔令新每年都要听到不少，他说：“患者的赞美只能让我更加小心。因为他们抱了那么大希望来找我，我不能让他们失望。中医是很严谨的科学。只有医生认真仔细的诊疗，才能让患者有更好的康复。”
